El Centro de Alumnos del Colegio Don Bosco, está integrada por siete jóvenes alumnos salesianos, quienes son elegidos por sus propios compañeros de colegio en un proceso de elección democrática, para oficiar como sus representantes durante el transcurso de un año.

Los cargos que conforman esta Directiva son:

• Profesor Asesor Laica, el Profesor Sr. Pablo Molina Lísperguer.

Las funciones y atribuciones del Centro de Estudiantes se rigen por los Estatutos Nacionales de Centros de Alumnos Salesianos emanados de la Inspectoría Salesiana, y por el Reglamento Interno del Colegio Don Bosco de Iquique, generado a partir de dicho estatuto por la misma Directiva y una comisión de representantes de la comunidad educativo pastoral.

Entre las labores que cumple el Centro de Estudiantes, se encuentra la de representar y canalizar las inquietudes de los estudiantes, coordinar las diferentes actividades que se desarrollan en el colegio a nivel del alumnado y estar en contacto permanente con los presidentes de cada curso.